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@@ -0,0 +1,146 @@
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function [outputDir, paramInfo] = generateResultDir(param, resultDir, extra)
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%Generate output directory for GPU and GPU_MS engines
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% Written by YJ
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paramInfo = strcat(param.method,'_',param.opt_errmetric,'_p',num2str(param.probe_modes),'_g',num2str(param.grouping));
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if isfield(param,'asize_presolve') && length(param.asize_presolve)==2
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_Ndp',num2str(param.asize_presolve(1)));
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||||
end
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if strcmp(param.method, 'MLc') && param.accelerated_gradients_start < param.number_iterations
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_ag',num2str(param.accelerated_gradients_start));
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||||
end
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if strcmp(param.method, 'MLc') && param.momentum ~=0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_m',num2str(param.momentum));
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end
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if param.beta_object < 1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_betaO',num2str(param.beta_object));
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end
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if param.beta_probe < 1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_betaP',num2str(param.beta_probe));
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||||
end
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%{
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if isfield(param,'beta_LSQ')
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_betaLSQ',num2str(param.beta_LSQ));
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end
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if param.delta_p ~= 0.1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_LSQdamping',num2str(param.delta_p));
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end
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%}
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if param.probe_position_search < param.number_iterations
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_pc',num2str(param.probe_position_search));
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if isfield(param,'apply_relaxed_position_constraint') && ~param.apply_relaxed_position_constraint
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_noModel');
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elseif ~isempty(param.probe_geometry_model)
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if ismember('scale', param.probe_geometry_model)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_scale');
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end
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if ismember('asymmetry', param.probe_geometry_model)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_asym');
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||||
end
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||||
if ismember('rotation', param.probe_geometry_model)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_rot');
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||||
end
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if ismember('shear', param.probe_geometry_model)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_shear');
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||||
end
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||||
%for i=1:length(param.probe_geometry_model)
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% paramInfo = strcat(paramInfo,'_',param.probe_geometry_model{i});
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%end
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||||
end
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||||
if isfield(param,'update_pos_weight_every') && param.update_pos_weight_every< param.number_iterations
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_updW',num2str(param.update_pos_weight_every));
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||||
end
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if param.probe_position_error_max < inf
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%paramInfo = strcat(paramInfo,'_maxError',num2str(param.probe_position_error_max/1e-9),'nm');
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_maxError',num2str(param.probe_position_error_max));
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||||
end
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||||
if isfield(param,'max_pos_update_shift') && param.max_pos_update_shift~=0.1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_maxUpdShift',num2str(param.max_pos_update_shift));
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||||
end
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||||
if isfield(param,'probe_position_search_momentum') && param.probe_position_search_momentum>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_m',num2str(param.probe_position_search_momentum));
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end
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||||
end
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if param.detector_scale_search < param.number_iterations
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_detScaleSearch',num2str(param.detector_scale_search));
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end
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if param.probe_fourier_shift_search < param.number_iterations
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_fpc',num2str(param.probe_fourier_shift_search));
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||||
end
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if param.background>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_bg',num2str(param.background));
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end
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if param.delta>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_delta',num2str(param.delta));
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||||
end
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if param.reg_mu>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_regSmooth',num2str(param.reg_mu));
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||||
end
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if isfield(param,'TV_lambda') && param.TV_lambda>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_TV',num2str(param.TV_lambda));
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||||
end
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||||
if param.positivity_constraint_object>0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_posObj',num2str(param.positivity_constraint_object));
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||||
end
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if param.variable_probe
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_vp',num2str(param.variable_probe_modes));
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if param.variable_probe_smooth>0
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||||
paramInfo = strcat(paramInfo,'_smooth',num2str(param.variable_probe_smooth));
|
||||
end
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||||
end
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||||
if param.variable_intensity
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_vi');
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||||
end
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||||
if param.apply_multimodal_update
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||||
paramInfo = strcat(paramInfo,'_mm');
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||||
end
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||||
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if is_used(param, 'fly_scan')
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_apFly',num2str(param.Nmodes));
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||||
end
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||||
if ~isempty(param.delta_z)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_Ns',num2str(length(param.delta_z)));
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||||
paramInfo = strcat(paramInfo,'_dz',num2str(mean(param.delta_z)));
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||||
if param.regularize_layers~=0
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_reg',num2str(param.regularize_layers));
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end
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||||
if param.preshift_ML_probe
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_centerProbe');
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end
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||||
end
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if any(param.custom_data_flip)
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_dpFlip');
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if param.custom_data_flip(1)==1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_lr');
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end
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||||
if param.custom_data_flip(2)==1
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paramInfo = strcat(paramInfo,'_ud');
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end
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||||
if param.custom_data_flip(3)==1
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||||
paramInfo = strcat(paramInfo,'_T');
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end
|
||||
end
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%{
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if any(param.det_bad_pixels(:))
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output = strcat(output,'_badPixels');
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end
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%}
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if nargin==3
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paramInfo = strcat(paramInfo,extra);
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end
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||||
outputDir = strcat(resultDir,'/',paramInfo,'/');
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||||
end
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